Boksery to rasa średnio długowieczna, z typowych chorób psów dużych występuje u nich dysplazja stawów biodrowych, i groźny dla życia skręt żołądka. Aby zmniejszyć ryzyko jego wystąpienia, należy psu zapewnić zupełny spokój przez co najmniej godzinę po jedzeniu. Dość częsta jest spondyloza – zwyrodnienie kręgów, prowadzące do niedowładów i porażenia kończyn. Groźna dla życia jest zdarzająca się u tej rasy kardiomiopatia rozstrzeniowi. Jej pierwsze objawy to szybkie męczenie się, kaszel i przyspieszony oddech. Rokowanie jest niepomyślne – mimo leczenia choroba postępuje i prowadzi do śmierci w ciągu 1-2 lat. Bokser ma też skłonność do uczuleń i chorób skóry, i częściej niż przeciętnie występują u tej rasy nowotwory układu chłonnego.